Testen BLAST- en Entrez-competenties - antwoorden en hints

OPGAVE 1

schimmel, plant, bacterie (E. coli)  dus helaas nog steeds geen dino DNA-sequenties.....

 

  

OPGAVE 2 

100% identiek aan stukje mitochondrieel DNA van Cervus elaphus = red deer = edelhert

OPGAVE 3

 P12655

a. P12655

b.
664 az (het is dus vrij groot, want het gemiddelde bacterie-eiwit is tussen de 300 en de 350 az groot)

c. Tip: kijk naar de titels van de tijdschrift-artikelen die in deze entry staan vermeld. De titel van het artikel van Ajdic et al. geeft het antwoord op de vraag over de natuurlijke habitat, maar doorklikken naar de bijbehorende abstract in Medline maakt het nog duidelijker. Nu kun je waarschijnlijk zelf wel bedenken waarom sucrose-transport in die habitat zo handig is....

d.
80 (of eigenlijk 79 want het eiwit zelf (P12655) staat ook in de lijst.

e. Zullen we in de les bespreken.

f. Rauch en De Vos

 

OPGAVE 4

a. het oog

b.

1. verschillende types van autosomaal dominant cataract. MIM:604219

2. congenital cerulean cataract type 3 (CCA3) MIM:608983

3. progressive punctate cataract MIM:123690

4. crystalline aculeiform cataract (CACA) MIM:115700

Opmerking bij c-e: je kunt dit ook doen door de code P07320 in het zoekvenster te zetten i.p.v. de sequentie.

c. nee

d. nee

e. nee

f. nee, want de ooglens-eiwitten zijn zeer gespecialiseerde eiwitten, die blijkbaar geen orthologen hebben in organismen zonder ooglenzen.