Opdracht bio-informatica van oorsmeer - ANTWOORDEN

Vraag 1: als het goed is niet zo ingewikkeld.....

Vraag 2:  

a.  Yoshiura

b. Nat Genet. (= Nature Genetics)

c. Eerste voorbeeld van dna polymorfisme dat leidt tot een zichtbaar genetisch kenmerk.

d. ATP-binding cassette transporter sub-family C member 11 (Multidrug resistance-associated protein 8).

e. Bera,T.K., Lee,S., Salvatore,G., Lee,B. and Pastan,I.. 2001

f. G naar R op positie 189 = van gly naar arg.

g. transmembrane regions 12

h. ATP-bindende gebieden

Vraag 3:

a. 16p11.2-16q12.1

b. Tomita

c. Nagasaki University

Vraag 4:

a. 16p11.2-q12.1

b. ja, uiteraard zelfde gebied als oorsmeer locus

Vraag 5: Zoek deze drie artikelen op in PubMed. 

a.

Yabuuchi H, Shimizu H, Takayanagi S, Ishikawa T. Related Articles, Links
Abstract Multiple splicing variants of two new human ATP-binding cassette transporters, ABCC11 and ABCC12.
Biochem Biophys Res Commun. 2001 Nov 9;288(4):933-9.
PMID: 11688999 [PubMed - indexed for MEDLINE]
2: Bera TK, Lee S, Salvatore G, Lee B, Pastan I. Related Articles, Links
Abstract MRP8, a new member of ABC transporter superfamily, identified by EST database mining and gene prediction program, is highly expressed in breast cancer.
Mol Med. 2001 Aug;7(8):509-16.
PMID: 11591886 [PubMed - indexed for MEDLINE]
3: Tammur J, Prades C, Arnould I, Rzhetsky A, Hutchinson A, Adachi M, Schuetz JD, Swoboda KJ, Ptacek LJ, Rosier M, Dean M, Allikmets R. Related Articles, Links
Abstract Two new genes from the human ATP-binding cassette transporter superfamily, ABCC11 and ABCC12, tandemly duplicated on chromosome 16q12.
Gene. 2001 Jul 25;273(1):89-96.
PMID: 11483364 [PubMed - indexed for MEDLINE]

b. Bera et al.

c. Tammur et al.

Vraag 6: 

a. 38; transport de cel in of uit; geen verrassing: waarschijnlijk zoŽn handige basis-eigenschap (transport van verbindingen de cel in of uit via actief transport mbv ATP) dat dit gen veelvuldig is gedupliceerd en vervolgens via dna-veranderingen zodanig veranderd dat er transporteiwitten met  allerlei functies ontstonden.

b. Multidrug resistance-associated protein 5 (Multi-specific organic anion transporter-C) (MOAT-C) (pABC11) (SMRP)."We speculate that MRP5 might play a role in some cases of unexplained resistance to thiopurines in acute lymphoblastic leukemia and/or to antiretroviral nucleoside analogs in HIV-infected patients."

c. Welk van deze eiwitten is betrokken bij een zeer bekende erfelijke aandoening en welke aandoening is dat? het CFTR eiwit, cystic fibrosis of taaislijmziekte

Vraag 7:

a. veel. hier kun je allerlei functies noemen.

b. transport de cel in of uit. geen verrassing.

c. alfa-hemolysine = toxine en wordt dus naar buiten getransporteerd.

d. grote groep verwante eiwitten met gemeensch kenmerk transport maar met allerlei functies. zie verder 6a