Website van de opleiding BM Saxion Hogeschool Enschede
Biochemie

Onderdeel RZQ: ' Eiwitten op de computer'

Bij dit onderdeel van de module Biochemie (dat een kwart van het eindcijfer van de module Biochemie levert) worden via computerlessen en bijbehorend huiswerk twee doelen nagestreefd:

  1. Het bijbrengen van theoretische kennis over de bouw van de meest fascinerende biomoleculen: de eiwitten

  2. Het kennismaken met enkele handige computer-tools en databases die worden gebruikt in het moderne eiwitonderzoek

Je theoretische kennis (doel 1) wordt getoetst via het tentamen Biochemie in de tentamenweek (25% van dit tentamen zal bestaan uit vragen over de onderstaande studietaken). Aaangezien het bij de computertools en databases (doel 2) gaat om een praktische kennismaking wordt dit onderdeel niet getoetst.

  • De leer- en oefenstof heb ik verdeeld over studietaken. Elke studietaak gaat over een afgerond onderwerp. Hieronder vind je alle hiervoor benodigde informatie en links. De algemene manier van werken per studietaak is als volgt:Introductie van het onderwerp tijdens de les; dit is de zogenaamde 'intro-les'
  • Zelfstandig thuis bestuderen van de leerstof en maken van de oefeningen
  • Bespreking van problemen met de leerstof en de antwoorden op de oefeningen; dit is de zogenaamde 'besprekingsles' 

Lesplan 
Tentamen 2006-2007 
Antwoorden


De fascinerende wereld van de eiwitten: 

Protein Spotlight (klik op 'back issues' voor archief) 
Protein of the Month (hier komen helaas sinds medio 2007 geen nieuwe eiwitten meer bij, maar het is nog steed een interessante lijst) 
Molecule of the Month 


Studietaak 1: Aminozuren en primaire structuur:

Leerdoelen en oefeningen 
Antwoorden oefeningen 
Start-ppt 
Ppt aminozuren 

Informatie over de aminozuren:  
Amino acid properties  
Amino acids and protein structure  
Amino Acid Information  
The Amino Acid Collection  
A review of amino acids 
Mijn eigen tekst over de aminozuren  
Proteins and Amino Acids movie 
Nieuwe links (vanaf 170909):
Aminozuren op Answers.com 
Waar komen de een letter codes vandaan?
Spelletjes, quizzen e.d.:
Amino acid recognition game 
Side by side amino acid viewer 
Amino acid quizzer
Amino Acids Quiz



Studietaak 2: Secundaire, tertiaire en quaternaire structuur 

Leerstof 
Oefeningen en Antwoorden 

Ondersteunende tutorials: 
Voor de 3D-plaatjes in deze tutorials heb je of Chime nodig of wordt automatisch de zogenaamde Jmol-applet geladen. Chime kun je op school achter een vaste PC activeren via het NAL-menu (dubbelklik MDLChime-icoon). Voor thuis of op je laptop kun je het programma gratis downloaden vanaf
www.mdl.com.
Introduction to Protein Structure (gebruikt Jmol) 
Molecules in Motion (gebruikt Chime en Jmol) 
Materiaal Universiteit Nijmegen
Nog drie tutorials over een aantal beroemde eiwitten: 
Insuline (gebruikt Chime) 
Hemoglobine  (gebruikt Chime)
Carboxypeptidase deel 1 (gebruikt Chime) 
Carboxypeptidase deel 2 (gebruikt Chime) 

Eiwitgames:
Foldit

 


 

Studietaak 3: Post-translationele modificaties 

Leerstof en oefeningen (incl. antwoorden)
 


Ppt 


Studietaak 4: Handige computertools 


 

Biochemie
Informatie- en onderzoeksvaardigheden
Medische Microbiologie
Moleculaire Biologie
HomeAlgemeen1e jaar2e jaar3e en 4e jaarCrime ScienceUTForumContacteer mij